Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp2aQ9DB34 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp2aQ9DB34 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chmp2aQ9DB34 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp2aQ9DB34 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp2aQ9DB34 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp2aQ9DB34 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2aQ9DB34 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp2aQ9DB34 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp2aQ9DB34 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp2aQ9DB34 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms