Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmtm2bQ9DAC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms