Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA48

Spaca1, Sperm acrosome membrane-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spaca1Q9DA48 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spaca1Q9DA48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spaca1Q9DA48 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spaca1Q9DA48 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spaca1Q9DA48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spaca1Q9DA48 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spaca1Q9DA48 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spaca1Q9DA48 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms