Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actrt1Q9D9J3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actrt1Q9D9J3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actrt1Q9D9J3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actrt1Q9D9J3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actrt1Q9D9J3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actrt1Q9D9J3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actrt1Q9D9J3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms