Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms