Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clca1Q9D7Z6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca1Q9D7Z6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca1Q9D7Z6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca1Q9D7Z6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clca1Q9D7Z6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca1Q9D7Z6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca1Q9D7Z6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms