Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabra4Q9D6F4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra4Q9D6F4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra4Q9D6F4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabra4Q9D6F4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabra4Q9D6F4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabra4Q9D6F4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms