Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam227bQ9D518 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam227bQ9D518 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam227bQ9D518 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam227bQ9D518 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227bQ9D518 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam227bQ9D518 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam227bQ9D518 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam227bQ9D518 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.1 ms