Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clvs1Q9D4C9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clvs1Q9D4C9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clvs1Q9D4C9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clvs1Q9D4C9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clvs1Q9D4C9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clvs1Q9D4C9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms