Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Syce1Q9D495 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syce1Q9D495 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syce1Q9D495 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syce1Q9D495 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syce1Q9D495 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syce1Q9D495 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syce1Q9D495 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Syce1Q9D495 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syce1Q9D495 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syce1Q9D495 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syce1Q9D495 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syce1Q9D495 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syce1Q9D495 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syce1Q9D495 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syce1Q9D495 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syce1Q9D495 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce1Q9D495 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce1Q9D495 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syce1Q9D495 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syce1Q9D495 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms