Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3I0

5530400C23Rik, RIKEN cDNA 5530400C23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530400C23RikQ9D3I0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
5530400C23RikQ9D3I0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
5530400C23RikQ9D3I0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
5530400C23RikQ9D3I0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
5530400C23RikQ9D3I0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5530400C23RikQ9D3I0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
5530400C23RikQ9D3I0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
5530400C23RikQ9D3I0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms