Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
D930007J09RikQ9D2K6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D930007J09RikQ9D2K6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
D930007J09RikQ9D2K6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
D930007J09RikQ9D2K6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D930007J09RikQ9D2K6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D930007J09RikQ9D2K6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms