Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chordc1Q9D1P4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Chordc1Q9D1P4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chordc1Q9D1P4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chordc1Q9D1P4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chordc1Q9D1P4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chordc1Q9D1P4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chordc1Q9D1P4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms