Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srsf9Q9D0B0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srsf9Q9D0B0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srsf9Q9D0B0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf9Q9D0B0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf9Q9D0B0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms