Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc47Q9D024 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc47Q9D024 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc47Q9D024 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc47Q9D024 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc47Q9D024 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc47Q9D024 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc47Q9D024 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc47Q9D024 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc47Q9D024 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc47Q9D024 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc47Q9D024 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc47Q9D024 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc47Q9D024 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc47Q9D024 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc47Q9D024 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc47Q9D024 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc47Q9D024 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc47Q9D024 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc47Q9D024 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc47Q9D024 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc47Q9D024 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc47Q9D024 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms