Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Shisa9Q9CZN4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shisa9Q9CZN4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Shisa9Q9CZN4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shisa9Q9CZN4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shisa9Q9CZN4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms