Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mis18aQ9CZJ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mis18aQ9CZJ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mis18aQ9CZJ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mis18aQ9CZJ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mis18aQ9CZJ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mis18aQ9CZJ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mis18aQ9CZJ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mis18aQ9CZJ6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms