Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB0

Sdhc, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhcQ9CZB0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SdhcQ9CZB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SdhcQ9CZB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SdhcQ9CZB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SdhcQ9CZB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SdhcQ9CZB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SdhcQ9CZB0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms