Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm5Q9CXE0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm5Q9CXE0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm5Q9CXE0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm5Q9CXE0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm5Q9CXE0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms