Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX86

Hnrnpa0, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa0Q9CX86 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hnrnpa0Q9CX86 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hnrnpa0Q9CX86 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hnrnpa0Q9CX86 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hnrnpa0Q9CX86 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hnrnpa0Q9CX86 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hnrnpa0Q9CX86 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hnrnpa0Q9CX86 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms