Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Khdc3Q9CWU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Khdc3Q9CWU5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Khdc3Q9CWU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Khdc3Q9CWU5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Khdc3Q9CWU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Khdc3Q9CWU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Khdc3Q9CWU5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms