Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prps2Q9CS42 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Prps2Q9CS42 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prps2Q9CS42 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prps2Q9CS42 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prps2Q9CS42 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prps2Q9CS42 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prps2Q9CS42 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prps2Q9CS42 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prps2Q9CS42 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prps2Q9CS42 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prps2Q9CS42 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prps2Q9CS42 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prps2Q9CS42 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prps2Q9CS42 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prps2Q9CS42 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prps2Q9CS42 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prps2Q9CS42 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms