Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd1Q9CRY7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpd1Q9CRY7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd1Q9CRY7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdpd1Q9CRY7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdpd1Q9CRY7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms