Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3kQ9CQZ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr3kQ9CQZ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr3kQ9CQZ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Polr3kQ9CQZ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Polr3kQ9CQZ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Polr3kQ9CQZ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Polr3kQ9CQZ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Polr3kQ9CQZ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Polr3kQ9CQZ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Polr3kQ9CQZ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms