Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg12Q9CQY1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg12Q9CQY1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg12Q9CQY1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atg12Q9CQY1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg12Q9CQY1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms