Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifitm3Q9CQW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifitm3Q9CQW9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifitm3Q9CQW9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifitm3Q9CQW9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifitm3Q9CQW9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifitm3Q9CQW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms