Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV4

Retreg3, Reticulophagy regulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg3Q9CQV4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retreg3Q9CQV4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retreg3Q9CQV4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retreg3Q9CQV4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retreg3Q9CQV4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retreg3Q9CQV4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retreg3Q9CQV4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retreg3Q9CQV4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retreg3Q9CQV4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retreg3Q9CQV4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retreg3Q9CQV4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retreg3Q9CQV4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retreg3Q9CQV4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retreg3Q9CQV4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retreg3Q9CQV4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms