Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl20Q9CQL4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl20Q9CQL4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl20Q9CQL4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl20Q9CQL4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mrpl20Q9CQL4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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