Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp1b2Q9CQD4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp1b2Q9CQD4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp1b2Q9CQD4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp1b2Q9CQD4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp1b2Q9CQD4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp1b2Q9CQD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms