Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NepnQ9CQ76 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NepnQ9CQ76 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NepnQ9CQ76 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NepnQ9CQ76 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NepnQ9CQ76 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms