Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nudcd2Q9CQ48 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nudcd2Q9CQ48 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nudcd2Q9CQ48 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nudcd2Q9CQ48 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nudcd2Q9CQ48 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nudcd2Q9CQ48 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms