Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930519G04RikQ9CPT7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930519G04RikQ9CPT7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930519G04RikQ9CPT7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930519G04RikQ9CPT7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930519G04RikQ9CPT7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms