Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP7

Trim33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, mousemouse

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim33Q99PP7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim33Q99PP7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim33Q99PP7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim33Q99PP7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim33Q99PP7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim33Q99PP7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim33Q99PP7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim33Q99PP7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim33Q99PP7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim33Q99PP7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim33Q99PP7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim33Q99PP7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim33Q99PP7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim33Q99PP7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim33Q99PP7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim33Q99PP7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim33Q99PP7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms