Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn6Q99PL6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn6Q99PL6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ubxn6Q99PL6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn6Q99PL6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn6Q99PL6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn6Q99PL6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn6Q99PL6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn6Q99PL6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms