Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trem2Q99NH8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trem2Q99NH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trem2Q99NH8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trem2Q99NH8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trem2Q99NH8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trem2Q99NH8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trem2Q99NH8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trem2Q99NH8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trem2Q99NH8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trem2Q99NH8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trem2Q99NH8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trem2Q99NH8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trem2Q99NH8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trem2Q99NH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trem2Q99NH8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trem2Q99NH8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trem2Q99NH8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trem2Q99NH8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms