Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cadm3Q99N28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cadm3Q99N28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cadm3Q99N28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cadm3Q99N28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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