Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
CalcbQ99MP3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
CalcbQ99MP3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
CalcbQ99MP3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
CalcbQ99MP3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
CalcbQ99MP3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26,28■■□□□ 1,8
CalcbQ99MP3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
CalcbQ99MP3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,21■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
CalcbQ99MP3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26,18■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
CalcbQ99MP3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,08■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
CalcbQ99MP3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
CalcbQ99MP3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,96■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,95■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,95■■□□□ 1,75
CalcbQ99MP3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,89■■□□□ 1,74
CalcbQ99MP3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
CalcbQ99MP3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
CalcbQ99MP3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,87■■□□□ 1,73
CalcbQ99MP3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
CalcbQ99MP3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,8 ms