Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tlr3Q99MB1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr3Q99MB1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr3Q99MB1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr3Q99MB1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr3Q99MB1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr3Q99MB1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr3Q99MB1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tlr3Q99MB1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tlr3Q99MB1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlr3Q99MB1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlr3Q99MB1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlr3Q99MB1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tlr3Q99MB1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr3Q99MB1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr3Q99MB1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms