Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdca3Q99M54 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdca3Q99M54 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdca3Q99M54 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdca3Q99M54 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdca3Q99M54 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdca3Q99M54 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdca3Q99M54 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms