Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpd3Q99LY2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpd3Q99LY2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdpd3Q99LY2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpd3Q99LY2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdpd3Q99LY2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdpd3Q99LY2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gdpd3Q99LY2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 538.9 ms