Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcc1Q99LI2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcc1Q99LI2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcc1Q99LI2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcc1Q99LI2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcc1Q99LI2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcc1Q99LI2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcc1Q99LI2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcc1Q99LI2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms