Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnpo2Q99LG2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnpo2Q99LG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnpo2Q99LG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnpo2Q99LG2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnpo2Q99LG2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnpo2Q99LG2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnpo2Q99LG2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnpo2Q99LG2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnpo2Q99LG2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnpo2Q99LG2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnpo2Q99LG2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnpo2Q99LG2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnpo2Q99LG2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnpo2Q99LG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnpo2Q99LG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms