Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DhddsQ99KU1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DhddsQ99KU1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DhddsQ99KU1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DhddsQ99KU1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DhddsQ99KU1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DhddsQ99KU1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DhddsQ99KU1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DhddsQ99KU1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DhddsQ99KU1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DhddsQ99KU1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DhddsQ99KU1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DhddsQ99KU1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DhddsQ99KU1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DhddsQ99KU1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms