Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EpcamQ99JW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EpcamQ99JW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EpcamQ99JW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EpcamQ99JW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EpcamQ99JW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EpcamQ99JW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EpcamQ99JW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EpcamQ99JW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EpcamQ99JW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EpcamQ99JW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EpcamQ99JW5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms