Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfxn1Q99JR1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sfxn1Q99JR1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sfxn1Q99JR1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sfxn1Q99JR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfxn1Q99JR1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sfxn1Q99JR1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sfxn1Q99JR1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sfxn1Q99JR1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfxn1Q99JR1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfxn1Q99JR1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfxn1Q99JR1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfxn1Q99JR1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfxn1Q99JR1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms