Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubb6Q922F4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubb6Q922F4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tubb6Q922F4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Tubb6Q922F4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubb6Q922F4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tubb6Q922F4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tubb6Q922F4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubb6Q922F4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubb6Q922F4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tubb6Q922F4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubb6Q922F4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubb6Q922F4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms