Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp4Q921I6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp4Q921I6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp4Q921I6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp4Q921I6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp4Q921I6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp4Q921I6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp4Q921I6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp4Q921I6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp4Q921I6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp4Q921I6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms