Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpe65Q91ZQ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpe65Q91ZQ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpe65Q91ZQ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpe65Q91ZQ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpe65Q91ZQ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rpe65Q91ZQ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpe65Q91ZQ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpe65Q91ZQ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpe65Q91ZQ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpe65Q91ZQ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpe65Q91ZQ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpe65Q91ZQ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpe65Q91ZQ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms