Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pde6cQ91ZQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde6cQ91ZQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde6cQ91ZQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6cQ91ZQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde6cQ91ZQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6cQ91ZQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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