Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rab29Q91YQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab29Q91YQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab29Q91YQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab29Q91YQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab29Q91YQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms